Органом управления на территории свободной экономической зоны «Минск» является Администрация СЭЗ «Минск», осуществляющая регистрацию резидентов СЭЗ.
Работа администрации СЭЗ «Минск» организована по принципу «одного окна», что значительно упрощает процесс создания предприятий в СЭЗ. Имея необходимые полномочия и возможности, администрация СЭЗ оказывает инвесторам всестороннее содействие в подборе производственных площадей и земельных участков, подготовке минимально необходимой для производства инфраструктуры.